• 1. Lab of Experimental Oncology, Cancer Center, West China Hospital, Sichuan University, Chengdu 610041, P.R.China;
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三结构域蛋白家族 5(TRIM5)在自噬中起重要作用,并参与免疫和肿瘤进程,然而 TRIM5 在神经胶质瘤中的功能尚不清楚。本研究旨在通过生物信息学分析来评估 TRIM5 在胶质瘤中的作用。本研究神经胶质瘤数据库临床样本包括低级别神经胶质瘤(LGG)与多形性成胶质细胞瘤(GBM)。通过 Oncomine、基因表达谱交互分析(GEPIA)和癌症基因组图谱(TCGA)数据库探寻了 TRIM5 在胶质瘤组织中的表达。基于 TCGA 数据库,我们利用生存分析和多因素 Cox 回归分析评价 TRIM5 的预后作用。利用 STRING 数据库预测 TRIM5 相关蛋白网络,并通过 KEGG 富集分析预测 TRIM5 在胶质瘤中的潜在分子通路。此外,采用 CIBERSORT 和 TIMER 数据库进行免疫浸润分析。结果表明,与 Oncomine、GEPIA 和 TCGA 数据库中的正常样本相比,神经胶质瘤样本中的 TRIM5 表达明显上调。生存分析结果显示,较高的 TRIM5 表达与 LGG+GBM 患者以及 LGG 患者较差的总体生存(OS)有关,但与 GBM 患者 OS 无关。临床相关性分析结果显示,TRIM5 表达与年龄(χ2=44.31,P<0.001)、病理学分级(χ2=130.10,P<0.001)以及组织学类型(χ2=125.50,P<0.001)具有相关性。多因素 Cox 风险分析结果显示 TRIM5 表达(HR=1.48,95% CI=1.20~1.80,P<0.001)、年龄(HR=1.05,95% CI=1.03~1.10,P<0.001)以及病理学分级(HR=3.11,95% CI=2.30~4.20,P<0.001)是胶质瘤患者(LGG+GBM)预后的独立危险因素;TRIM5 表达(HR=1.82,95% CI=1.42~2.32,P<0.001)、年龄(HR=1.06,95% CI=1.05~1.08,P<0.001)、病理学分级(HR=1.92,95% CI=1.22~3.01,P=0.005)以及组织学类型(HR=0.71,95% CI=0.57~0.89,P=0.003)是 LGG 患者的独立预后因素。相互作用网络分析发现,IRF3、IRF7、OAS1、OAS2、OAS3、OASL、GBP1、PML、BTBD1 以及 BTBD2 蛋白与 TRIM5 具有相互作用。此外,KEGG 分析还发现细胞凋亡、肿瘤以及免疫相关通路在 TRIM5 升高时显著富集。免疫浸润分析显示,TRIM5 表达可以影响胶质瘤中活化 NK 细胞、单核细胞、活化肥大细胞、巨噬细胞等免疫细胞浸润水平。以上结果提示,TRIM5 在胶质瘤组织中显著上调,并与预后不良和免疫浸润相关。TRIM5 可能作为神经胶质瘤预后与指导免疫治疗的生物标志物。

引用本文: 陈悦, 李琴, 张洁, 顾睿, 李凯, 赵岗, 袁航, 丰天宇, 欧德琼, 林苹. TRIM5 高表达与胶质瘤患者不良预后和免疫浸润的相关性研究. 生物医学工程学杂志, 2020, 37(3): 469-479. doi: 10.7507/1001-5515.202004064 复制

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